Sarastro, el rei Sol, s'ha emportat al seu bosc de la Llum a la princesa Pamina parell que la reina de la Nit, la seva mare, víctima d'un embruixament, no la fetilli des del seu bosc de la Foscor.

 Un príncep anomenat Tamino apareix en el bosc de la reina de la Nit perseguit per una serp i la Núvia del Bosc aconseguirà salvar-lo per a després demanar-li que l'ajudi a unir els boscos trencats per l'embruixament que sofreix la reina. Per a això hauran d'anar al bosc de la Llum on està la princesa Pamina i aconseguir que vagi la reina de la Nit per a desembrujarla. El príncep comptarà amb l'ajuda d'una flauta màgica i un de pajarero anomenat Papageno. Finalment la reina es desembrujará, els prínceps s'enamoren, els reis es reconciliaran i Papageno trobarà el seu Papagena.